Hal ini menggerakkan PSSI untuk mengambil kekuatan dari masing-masing kompetisi dan menggabungkan menjadi satu dalam Liga Indonesia.
Gagasan mengenai Liga Indonesia terwujud pada 27 November 1994 dengan mempertandingkan juara Galatama 1993/1994 Pelita Jaya melawan juara Divisi Utama Perserikatan 1993/1994 Persib Bandung.
Pada tahun 2008, PSSI memodifikasi Liga Indonesia dengan nama Liga Super Indonesia. PSSI meminta kepada setiap klub untuk dikelola secara profesional dan mandiri.
Faktanya, ada beberapa klub yang sudah terbiasa mendapatkan sokongan dana dari Pemda menjadi hancur lebur. Tengok saja nasib Sriwijaya FC dan Persipura Jayapura yang dahulu berjaya, kini terdampar di Liga 2.